Рейтингование - дело неоднозначное. В недавней версии от Российской газеты (декабрь 2009) представлены университеты, по крайней мере по названию (многие вузы просто не дотягивают до этого звания, и суть их не поменялась при переименовании). Судя по верхушке лидеров, данный рейтинг ловит сильные государственные вузы, по крайней мере по естественно-научному профилю. Что происходит в середине списка, не очень ясно. Специализированные институты, высшие школы и академии не представлены. Забавно, что в списке нет РГГУ.
Вообще, официальное название данного рейтинга, поддержанного Министерством образования и науки РФ "Национальный рейтинг российских вузов", выглядит странно. Нет медицинских вузов, нет МГИМО, Вышки, РЭШ, ФинАка и Бауманки. Неужели не тянут по рейтингу? Было бы неплохо взглянуть на какой-нибудь МАИ-МЭИ в сравнении с переферийными вузами. Интересный, конечно, рейтинг нарисован, но нашим 11 классникам не нужно на нем зацикливаться, да и вообще обращать внимание. Лучше походить по форумам вузов, пообщаться с выпускниками-студентами, послушать советы учителей.

Дополнение. 2010-2011 г.
Признанные в мире рейтинги:
Лучшие вузы мира 2011. МГУ в топе рейтинга репутаций Times Higher Education
Лучшие сто университетов мира по версии Times Higher Education